双歧杆菌分解水苏糖产生大量的短链脂肪酸，能刺激肠道蠕动、增加粪便润湿度并保持一定的渗透压，避免了粪便积存在大肠，水分被吸收，形成干硬的粪块，从而防止便秘的发生。在人体实验中，每天摄入3克水苏糖，一周之内便可起到改善便秘的效果，但对一些严重的便秘患者效果不佳。