一、提取的原料及工艺不同

水苏糖是从天然存在的蔬菜植物中提取的，这种蔬菜中国人已经食用了数千年，没有任何不良反应的报道，提取水苏糖的溶剂为水，不添加任何其他有机溶剂，产品中也不会有有机溶剂残留，这样食用十分安全，出口也不会有任何限制。

  大豆低聚糖是提取大豆蛋白的副产品。从大豆中提取大豆蛋白后，产生大量的大豆乳清，若直接排放，会对环境造成很大的污染。所以，一般将此有机废水利用，从中提取大豆低聚糖。由于大豆乳清成分较复杂，所以提取的工艺较繁琐，质量也较难控制。

二、大豆低聚糖的功效成分也是水苏糖，但其有效成分含量很低，杂质含量高，提纯很困难

大豆低聚糖的主要功效成分就是水苏糖、棉子糖，但因为常常含有其他多种普通糖类，如：蔗糖、葡萄糖等，这样就限制了它不能给糖尿病人和高血糖人群食用，所以它的使用面远比不上高纯度水苏糖。

大豆低聚糖的一般组成为: 

名称

水分

水苏糖

棉子糖

蔗糖

其它

糖浆

24

18

8

34

16

颗粒

3

23

7

44

23

混合粉末

3

11

4

22

60

精制品

24

32

17

5

22

虽然大豆低聚糖的主要成分也是水苏糖，但要将水苏糖从中提纯出来相当困难，成本也会大幅增加。

三 、水苏糖的保健用量少

公司生产的水苏糖保健用量是0.5-3克/天，而大豆低聚糖的保健用量是8-10克/天。所以大豆低聚糖的功效远比不上水苏糖。

四、水苏糖结构清楚，功效因子明确

水苏糖可以作为医用原料添加进药品中，作为辅助治疗剂使用。大豆低聚糖不能作为医用原料使用。

五、水苏糖节能环保